Ons laboratorium biedt gespecialiseerde DNA-analysetechnieken en dataverwerking, waarmee we gedetailleerd inzicht geven in het microbioom van bijvoorbeeld bodemmonsters, maar ook het microbioom van vergistingsinstallaties.

Wat is qPCR?
Kwantitatieve polymerasekettingreactie (qPCR)
Met qPCR technologie kunnen we de unieke 'vingerafdrukken' van micro-organismen herkennen in complexe monsters. Net zoals onze vingerafdrukken uniek zijn, heeft elk micro-organisme specifieke DNA-sequenties. Dankzij qPCR analyses kunnen we deze specifieke sequenties detecteren en ook de exacte aantallen van een bepaald micro-organisme vaststellen. Of het nu gaat om biomassa-afbrekende bacteriën, stikstofbinders of ziekteverwekkers. Het resultaat: een exact beeld van welke en hoeveel micro-organismen aanwezig zijn in uw monster.

Voordelen qPCR ten opzichte van traditionele kweekmethoden:

• Nauwkeurig detectie van specifieke organismen op basis van genen (target).
• Duidelijke kwantitatieve resultaten (exacte aantallen).
• Snelle testresultaten.
• Ook niet-kweekbare micro-organismen aantonen. Het merendeel van de aanwezige micro-organismen (ongeveer 99%) op aarde is niet kweekbaar.
• We kunnen meerdere targets tegelijk analyseren.

Primers en Primer Design

Om een succesvolle qPCR bepaling uit te voeren, zijn hoogwaardige primers essentieel. We beschikken over een uitgebreide collectie standaard primers gerelateerd aan bodemgezondheid en biovergisting (biomassa afbrekers).

Voor niet alle target micro-organismen zijn al standaard primers beschikbaar. Bij Bioclear earth kunnen wij specifieke primers ontwikkelen, die het gewenste DNA nauwkeuring detecteren. Dit stelt ons in staat om specifieke doelen te identificeren en te analyseren, afgestemd op uw behoeften. Bijvoorbeeld voor het detecteren van ziekteverwerkers of de aanwezigheid van micro-organismen die nodig zijn voor afbraak van bepaalde stoffen.

Wat is NGS?
NGS (Next-Generation Sequencing)
Door middel van NGS bieden we diepgaande inzichten in de microbiële samenstelling van jouw monsters. Het gaat hierbij niet om een specifieke soort zoals bij qPCR, maar om de totale samenstelling, het netwerk van micro-organismen (Microbioom) dat zich in de bodem, water of slib, biomassamateriaal bevindt. Hierdoor kunnen we inzicht geven in de biodiversiteit en de biologische processen die zich afspelen en specifieke vragen beantwoorden: zoals bevat mijn bodem stikstofafbrekers en plantgroeibevorderende bacteriën.